Covid-19 Méthodologie et paramètres utilisés
Les paramètres de transmission, confinement, gestes barrières, port du masque et tracking
Le taux de transmission brute et le taux d'asymptomatiques
Au début de la pandémie en France le paramètre retenu de transmission brute est de 3.45
Une première version de simulation a été réalisée avec un taux de 3 et un taux d'asymptomatique de 80% (étude de Hanovre).
L'information de l'Institut Pasteur indiquant un taux de 4.4% de la population contaminée au 11/05/2020 invalidait les deux premiers paramètres.
Pour valider cette information et reproduire le nombre de contaminés validés (symptomatiques et ou pas testés), il fallait modifier les 2 paramètres :
- le taux de transmission brute passe de 3 à 3.45 dans la simulation
- le taux de d'asymptomatique passe de 80% (1ère version de simulation en avril 2020) à 95.25% (modification de la simulation en juin 2020)
L'étude EPICOVID publiée le 09/10/2020 confirme les données de mai 2020 et propose un taux de population contaminée de 4.5%. Ceci correspond à un taux d'asymptomatiques de 95.25%
source : publications Institut Pasteur
- à partir d'octobre 2020, le taux d'asymptomatique retenu est de 95.25%
- Une nouvelle étude de type EPICOVID est lancée en octobre 2020 pour confirmer ou pas ces paramètres sur cette période (résultats sous 4 à 6 mois).
Le taux sera peut être différent, mais certainement dans la même zone de valeur.
Par contre le nombre de contaminés validés et testés a évolué durant l'été :
- une forte augmentation des tests ouverts à tous
- une part non négligeable de testés confirmés sont asymptomatiques : ils seront pris en compte à hauteur de 20% à partir du 20/07/2020 et de 30% à partir du 10/08/2020.
- cette prise en compte aboutit au 17/11/2020 à un taux global de 93.36% d'asymptomatiques non testés (coef 14 à pratiquer sur le nombre de testés positifs)
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Une nouvelle version du virus et un taux de transmission en forte augmentation
A partir de mi-octobre 2020, il devient impossible de simuler le nombre de contaminés réels à partir des paramètres précédents. Sauf à réduire l'impact des actions de confinement et de gestes barrières à 0%. Alors que le raisonnable est de conserver un impact des restrictions à l'oeuvre en octobre de 10% (pas de public dans les stades, pas de concerts, pas de grands rassemblements etc..) et des gestes barrières pour 30%.
Des études présentent cette possibilité de nouveau virus, plus contaminant (à confirmer) à partir de l'été en Espagne et diffusé dans différents pays européens ensuite dont la France.
En exploitant cette possibilité et en conservant l'impact des actions de protection, il est possible de simuler cette hausse de cas déclarés en incorporant cette nouvelle version à hauteur de 18% au 10/10/2020 pour passer à 100% au 18/11/2020.
Le chiffre déduit s'impose par la réalité des cas contaminés déclarés. Il est de 12.81 au lieu de 3.45 (taux de transmission brute) soit 3.7 fois plus contaminant que la première version.
Ceci n'est pas une démonstration scientifique étayée par des études mais le constat mathématique de la réalité.
L'impact du confinement
La simulation prend en compte le confinement selon la période :
- mars avril 2020 : 57% de confinement. Cela tient compte des activités qui restait en fonctionnement : santé, agriculture, agro-alimentaire, commerces alimentaires etc..
- réduction progressive pendant le déconfinement avec un point bas à 7% courant août 2020 (impact des vacances)
- la rentrée en septembre le taux de confinement a été fixé à 10% : reprise des activités scolaires mais pas de spectacles, de stades et de grands rassemblements
- la mise en place du second confinement fin octobre 2020 porte le taux de confinement (ou taux de réduction de la transmission) à 35% avec l'arrêt des activités commerciales de proximité et la réduction des déplacements
- En observant l'évolution des contaminations, il est possible de réduire le confinement fin novembre 2020 et de le passer de 30% à 10%, c'est à dire de revenir à la situation de septembre.
- Il est possible de réduire complétement le confinement fin décembre 2020 tout en conservant les gestes barrières et le port du masque sur le début 2021.
L'impact des gestes barrières et du port du masque
Dans la simulation les gestes barrières et le port du masque sont pris à 30% de réduction de la transmission chacun. Ce n'est 30 + 30 mais 0.7 x 0.7 = 49 % de cibles restantes.
L'usage s'est fait progressivement au début avec un relachement certain durant les vacances d'été (20%) et un peu avec la reprise des étudiants en septembre (25%)
La tracking manuel ou informatique TousAntiCovid
Le gain affecté au tracking est estimé dans l'étude à 12%.
La part manuelle s'est rodée durant l'été et à la rentrée de septembre. Par contre fin octobre quand le nombre de contaminations s'est envolé, le tracking manuel a été débordé. Il est peut être un peu suppléé par l'application TousAntiCovid. Ce taux de 12% devrait augmenter si l'application était plus massivement utilisée. Avec trois fois plus d'usagers le gain se traduit par 3500 décès en moins à partir du 30/11/2020.
